Trong bối cảnh một số cựu quan chức cấp Bộ trưởng và Thứ trưởng Bộ Hải dương và thủy sản Hàn Quốc đã bị bắt giam và khởi tố do bị nghi ngờ can thiệp bất chính vào hoạt động của Ủy ban đặc biệt điều tra thảm họa chìm tàu Sewol 16/4/2014, mới đây theo kết quả thu thập tin tức của Đài Phát thanh và truyền hình Hàn Quốc KBS thì Phủ Tổng thống mới là cơ quan chỉ đạo việc can thiệp, cụ thể hơn là nhiều cơ quan chủ chốt của Chính phủ đã được huy động cho việc này. 
 
Vào tháng 3/2015, tức thời điểm ban đầu chuẩn bị thành lập Ủy ban đặc biệt, Thứ trưởng các Bộ Kế hoạch và tài chính, Bộ Hành chính nội vụ và Bộ Hải dương và thủy sản đã họp bàn tại tòa nhà phụ phía Tây trong Phủ Tổng thống về việc tìm kiếm phương án đối phó với Ủy ban đặc biệt điều tra thảm họa Sewol.
 
Trong số những tài liệu Viện Kiểm sát thu thập được có biên bản kết quả cuộc họp nói trên.
 
Khi đó cũng là thời điểm những tranh cãi về quy mô và ngân sách hoạt động của Ủy ban đặc biệt đang bị đẩy lên cao. Chính thời điểm này, một số cơ quan chủ chốt trong Chính phủ đã họp kín để bàn việc can thiệp, gây trở ngại cho công tác điều tra.
 
Các cuộc họp tương tự còn được tổ chức thêm nhiều lần nữa nên Viện Kiểm sát đang đặc biệt quan tâm đến vai trò của Phủ Tổng thống trong vụ việc này.
 
Theo kết quả điều tra của các công tố viên, trên thực tế, từ trước đó, vào tháng 1 năm 2015, cựu Cố vấn các vấn đề Nhà nước và chính trị Phủ Tổng thống Cho Yoon-sun từng triệu tập một số quan chức, trong đó có Bộ trưởng Bộ Hải dương và thủy sản khi đó là Kim Yeong-seok đến một khách sạn ở Seoul, khiển trách việc cơ cấu và ngân sách cho ủy ban đặc biệt quá lớn, đồng thời ra chỉ thị về việc bộ này phải chịu trách nhiệm thu gọn cơ cấu của ủy ban đặc biệt và làm sao để Chính phủ nắm quyền kiểm soát hoạt động của ủy ban trên.
 
Sau đó, Bộ Hải dương và thủy sản đã thành lập nhóm chuyên trách, hoạt động một cách có tổ chức và đã thành công trong việc thu nhỏ cơ cấu cũng như rút bớt ngân sách của ủy ban điều tra.
 
Đặc biệt, các công tố viên đã điều tra được rằng Bộ Hải dương và thủy sản báo cáo trực tiếp liên quan đến việc điều tra "Bảy tiếng vắng mặt của Tổng thống Park Geun-hye" cho Chánh văn phòng Phủ Tổng thống Lee Byung-ki.
 
Hiện, Viện Kiểm sát đang tiến hành khởi tố cựu Bộ trưởng Hải dương và thủy sản Kim Yeong-seok và Thứ trưởng Yoon Hak-bae khi đó theo những nội dung điều tra được, đồng thời đang cân nhắc thời điểm triệu tập thẩm vấn cựu Chánh văn phòng Phủ Tổng thống Lee Byung-ki và cựu Cố vấn các vấn đề Nhà nước và chính trị Phủ Tổng thống Cho Yoon-sun.